Sakura est une petite fille qui vit avec son père et son frère dans la ville de Tomoeda. Elle va à l'école, fait ses devoirs, sort avec ses amis et se dispute avec son frère, bref elle a une vie tout à fait normale.
Un jour, Sakura découvre dans la bibliothéque de son père, un livre magique. En l'ouvrant, les cartes qu'il contient s'envole et une petite créature ressemblant à une peluche apparait. Cette créature s'appelle Keroberos et il est le gardien des cartes contenue dans le livre, les cartes de Clow. Ces cartes ont été créé par un puissant magicien nommé Clow Read. Leurs pouvoirs sont immenses. Une fois libéré, elles peuvent être dangeureuse. Kerobero charge alors Sakura de partir à la recherche des cartes de Clow et de les capturer grâce à un sceptre magique.
Aidée de Kerobero, de sa meilleure amie, Tomoyo, et son rival, Shaoran, Sakura va capturer les cartes de Clow et devenir la nouvelle maitresse des cartes de Clow.